【風冷式冷水機】冷卻水在冷卻塔內蒸發散熱的過程中水質不斷發生變化，引起積垢、腐蝕和堵塞。由于冷卻水系統的結垢、腐蝕和藻類滋生不是在短期內形成的，也不會在短期內對系統有破壞性的影響，所以，往往得不到運行管理人員足夠的重視。
另外，由于冷卻水系統比較簡單，設計人員對其重視不夠，并且，冷卻水的處理是給排水專業和暖通專業均相關的專業，所以，難免造成先天設計不盡合理。在設計過程中針對冷卻水系統易結垢腐蝕和菌藻滋生的特點，其處理方法也與冷凍水系統有所不同。
冷卻水的處理方法可分為化學法和物理法。【低溫冷水機】
(1) 化學法：目前，大型冷卻水系統多采用化學方法，為此必須在冷卻水中加入阻垢劑、緩蝕劑、殺菌滅藻劑及其配套的清洗劑等，從而形成了冷卻水的全套水處理技術。近幾年來，隨著我國國民經濟的快速發展，對水處理劑的研究和開發也有了長足的發展。
(2) 物理法:是近幾年開始普遍廣泛使用的一種方法，該方法運行費用低、使用方便、易于控制、無污染是一種比較理想的水處理方法。
冷卻水系統的水質對冷水機制冷效率有很大的影響，所以要對冷水機進行保養和清洗，讓冷水機處于健康穩定的運行狀態，才能延長冷水機使用壽命，如果長時間不清洗保養，有可能造成一定的損耗。【螺桿式冷水機】
